本院為衛生福利部核定之器官移植醫院，持續推動並發展移植醫學相關業務，目前可進行心、肺、肝、腎、眼角膜等大愛器官移植及親屬間捐贈肝臟、腎臟之活體移植。
值得一提的是107年05月31日肺臟移植團隊完成罕見的卡司特曼病，合併阻塞性細支氣管炎之雙肺移植。讓一位臥床2年多的14歲少女可以踏出醫院重見陽光、呼吸新鮮空氣。同年09月31日心臟移植團隊完成一位48位男性因嚴重心衰竭置放左心室輔助器且幸運等待25天即獲得大愛捐贈的心臟移植。
而本院之人體器官保存庫於106年04月12日通過後，提供給需要修補骨骼、肌腱、韌帶、眼角膜、皮膚、血管、羊膜、幹細胞等組織之病患一個受贈機會，讓器官捐贈者得以用不同方式來造福人群，延續大愛於人世間。
於111年7月起，本院成立肝移植中心，由陳堯俐教授帶領之肝臟移植團隊進行首例之成人對成人之活體肝臟移植手術。於112年6月本院通過衛福部心臟停止死亡後器官捐贈作業同意備查，並於同年9月7日成功本院第一例心臟停止後器官捐贈，成功捐贈肝臟、腎臟及眼角膜。